②石头城遗址发掘出土的箱式木棺
就在考古队沉浸在发现箱式木棺的喜悦中时，另一个重大发现让他们无意中破解了一个学术界争论多年的问题。
在对石头城内城的南门进行发掘时，他们发现，与保存较好、结构清楚的北门相反，现存的所谓南门仅仅是一个已经坍塌的豁口。多年来，学术界关于这个南门的争议很多，甚至是否存在也说法不一。此处墙体断面比较规整，部分由土坯整齐地垒成，门柱的痕迹还很清晰，在城内的对应部分有类似瓮城的构造，显然，这里的确应该是一个城门。
但探险家斯坦因1900年绘制的石头城平面图上，可以清楚看出内城只有一个北门，在斯坦因和差不多同时代的其他探险家留下的照片中也可以清楚地发现没有南门。
“此次调查研究我们发现南门的确存在，但和普通城门不同，这是一个暗门，从城墙外面完全看不出来，古代的正式名称是‘突门’。因为从内城南门现存的门道墙面和残存的门柱可以看出，门外墙体预留部分的厚度也是比较薄的，可以在短时间内挖穿并形成供人通行的门道。”艾涛说道。